将蛋白质结合位点的一组原子进行质子化。

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  • 许可证: GNU通用公共许可证v3 (GPLv3)
  • 作者: Lukas Heumos
  • 标签 promoe
  • 需求: Python !=3.0.*, !=3.1.*, !=3.2.*, !=3.3.*, !=3.4.*
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项目描述

promoe

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使用MOE和Pymol对选定的原子进行质子化。

概述

overview of promoe

功能

  • 自动质子化pdb id的结合位点

  • 移除质子化后无法与配体相互作用的溶剂原子

  • 提取残基电荷

  • 提取所有配体ID

  • 提取所有替代位置

历史

0.1.0 (2019-09-30)

  • 首次发布在PyPI。

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