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将PDB文件加载到rdkit中,并包含非标准残基

项目描述

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PDBInf允许您使用RDKit读取PDB文件,并从.cif(PDBx)模板文件分配键级。

# provide a PDBx defining the TPO nonstandard residue
nonstandard_residues = gemmi.cif.read('./tpo.cif')

# load a PDB file using the built-in standard amino acid doc and providing information on the nonstandard residues
pdbinf.load_pdb_file('./tpo.pdb', templates=[pdbinf.STANDARD_AA_DOC, nonstandard_residues])

项目详情


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源分布

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构建分布

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