用于二维和三维图像灰度方向分析的包
项目描述
OrientationPy是EPFL BIG (生物医学影像组)的受欢迎的Fiji插件OrientationJ的Pythonic继任者 (github)。它是一个库,可以接受2D图像或3D体积,并计算灰度级别的方向。关键步骤是计算图像梯度,为此我们提供了一系列不同的技术。
亮点
请参阅示例画廊,了解代码的一些小示例用法,允许计算类似于这样的方向图
其他值得注意的Python项目
我们在Python中了解到的其他灰度级测量软件
skimage.feature.structure_tensor:仅使用有限差分计算梯度
structure-tensor:使用Sobel滤波器计算梯度
pynamix.measure.orientation_map:基于FFT的方法
致谢
初始原型由Alexandru Vasile在访问EPFL成像中心6周期间编写,由PSI的Mariana Verezhak提供支持
我们使用其中一些数据进行测试:https://zenodo.org/record/5483719#.Yyra4vFBy2A
我们从这个cookie-cutter初始化了此存储库:https://github.com/Nekroze/cookiecutter-pypackage
历史
0.2.0.4(2023-01-20)实现了体素大小的各向异性
0.2.0.3(2023-01-13)将代码移动到/src/orientationpy,以便进行打包?
0.2.0.2(2023-01-13)将代码移动到/src,以便进行打包?
0.2.0.1(2023-01-13)移动到pyproject.toml
0.2.0.0(2023-01-13)在pip上的第一个版本(由于requirements.txt而无法工作)
项目详情
下载文件
下载适合您平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解更多关于安装包的信息。