单细胞生物信息分析插件。
项目描述
Orange3 单细胞
Orange3 的单细胞扩展包为分析单细胞数据增加了功能。小部件支持基因过滤、预处理、批次效应消除、基因和细胞评分以及聚类分析。这些小部件可以与其他 Orange 小部件无缝使用，包括来自 Orange3-Bioinformatics 扩展包的小部件。
功能
探索细胞多样性
- 从任何平台加载数据并过滤异常细胞
- 在样本和平台间归一化表达值
- 通过样本和多样本识别并探索亚种群
发现新的标记基因
- 使用多种方法识别每个亚种群的标记基因
- 使用基因本体富集来探索生物学意义并识别细胞类型
预测新的细胞类型
- 构建分类器以识别每个亚种群的细胞类型
- 在新数据样本上使用分类器预测细胞类型并关注有趣的细胞类型群体
下载文件
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源分布
orange3_singlecell-1.7.2.tar.gz (2.6 MB 查看散列)
构建分布
Orange3_SingleCell-1.7.2-py3-none-any.whl (798.8 kB 查看散列)
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orange3_singlecell-1.7.2.tar.gz 的散列
| 算法 | 散列摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 77ade57665dc5c14f41945a228640e2cbd00620abbf3ea6e52a198962e7f30db |
|
| MD5 | d207e4ee0f4e9750830c7bbfb160072d |
|
| BLAKE2b-256 | 72850f6f5b459853b3755f25c82b519f313235de010730c1550abd40e5d585cc |
关闭
Orange3_SingleCell-1.7.2-py3-none-any.whl 的散列
| 算法 | 散列摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 8f017098ad671ba02bc89b97a4602fb07748a4485b6c38a6c4d0e0bb73e1c077 |
|
| MD5 | e0759ba681caf4dcbeaffbda28e8ebd0 |
|
| BLAKE2b-256 | 1303b0ca0be1c9a5405de2546f3b85ee04ade001005d035a04711ff5f2d04760 |
