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OpenSlide的Python接口

项目描述

!!!这是一个临时的解决方案,以使 openslide-python 能够通过 PIP 安装而不会出现 SETUPTOOLS 问题!!!

OpenSlide Python 是 OpenSlide 库的 Python 接口。

OpenSlide 是一个 C 库,它提供了一个简单的接口用于读取全切片图像,也称为虚拟切片,这些是在数字病理学中使用的具有高分辨率的图像。这些图像在未压缩的情况下可能占用数十吉字节,因此无法使用为适合舒适地解压缩到 RAM 的图像而设计的标准工具或库轻松读取。全切片图像通常是多分辨率的;OpenSlide 允许以最接近所需缩放级别的分辨率读取少量图像数据。

OpenSlide 可以读取多种格式的虚拟切片

要求

  • Python 2 >= 2.6 或 Python 3 >= 3.3

  • OpenSlide >= 3.4.0

  • Python Imaging Library 或 Pillow

安装

  1. 安装 OpenSlide.

  2. pip install openslide-python

使用 PIL

setup.py 假定您想使用 Pillow 的 PIL 分支。如果您已经安装了经典的 PIL,您可以使用它代替。使用以下命令安装 OpenSlide Python:

pip install --no-deps openslide-python

或者,如果您是手动安装

python setup.py install --single-version-externally-managed --record /dev/null

更多信息

许可证

OpenSlide Python 在 GNU Lesser General Public License,版本 2.1 的条款下发布。

项目详情


下载文件

下载适用于您的平台的文件。如果您不确定要选择哪一个,请了解有关 安装包 的更多信息。

源分布

openslide-wrapper-1.1.2.tar.gz (315.3 kB 查看散列)

上传时间

构建分布

openslide_wrapper-1.1.2-cp37-cp37m-macosx_10_15_x86_64.whl (16.2 kB 查看散列)

上传时间 CPython 3.7m macOS 10.15+ x86-64

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