OpenSlide的Python接口
项目描述
!!!这是一个临时的解决方案,以使 openslide-python 能够通过 PIP 安装而不会出现 SETUPTOOLS 问题!!!
OpenSlide Python 是 OpenSlide 库的 Python 接口。
OpenSlide 是一个 C 库,它提供了一个简单的接口用于读取全切片图像,也称为虚拟切片,这些是在数字病理学中使用的具有高分辨率的图像。这些图像在未压缩的情况下可能占用数十吉字节,因此无法使用为适合舒适地解压缩到 RAM 的图像而设计的标准工具或库轻松读取。全切片图像通常是多分辨率的;OpenSlide 允许以最接近所需缩放级别的分辨率读取少量图像数据。
OpenSlide 可以读取多种格式的虚拟切片
Aperio (.svs, .tif)
Hamamatsu (.ndpi, .vms, .vmu)
Leica (.scn)
MIRAX (.mrxs)
Philips (.tiff)
Sakura (.svslide)
Trestle (.tif)
Ventana (.bif, .tif)
通用拼接 TIFF (.tif)
要求
Python 2 >= 2.6 或 Python 3 >= 3.3
OpenSlide >= 3.4.0
Python Imaging Library 或 Pillow
安装
pip install openslide-python
使用 PIL
setup.py 假定您想使用 Pillow 的 PIL 分支。如果您已经安装了经典的 PIL,您可以使用它代替。使用以下命令安装 OpenSlide Python:
pip install --no-deps openslide-python
或者,如果您是手动安装
python setup.py install --single-version-externally-managed --record /dev/null
更多信息
许可证
OpenSlide Python 在 GNU Lesser General Public License,版本 2.1 的条款下发布。
项目详情
下载文件
下载适用于您的平台的文件。如果您不确定要选择哪一个,请了解有关 安装包 的更多信息。
源分布
构建分布
散列 for openslide_wrapper-1.1.2-cp37-cp37m-macosx_10_15_x86_64.whl
算法 | 散列摘要 | |
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SHA256 | ae4e472123532a1e1b82ff1b466815da556f80eaa9be2796f420c2f5a013423b |
|
MD5 | 7a2eafa64e8b7b7152564e4f6737e15e |
|
BLAKE2b-256 | e00a8b2d6b8689b2abd2cdf4071a91b1d59621ca8584884f9e4ec88b4a94fef5 |