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用于Diamond Light Source Ltd. B24简单且一致的创建和解析OME元数据的包。

项目描述

omexml-dls

用于帮助简单且一致地创建和解析Diamond Light Source Ltd. B24的OME元数据的包。这是对python_bioformats的omexml.py的修改版,其中包含来自Allen Institute for Cell Science的aicsimageio版本omexml.py的一个部分(在文件中已标明)。此包扩展了功能,主要是在ROI方面,同时提供了一个轻量级的omexml文件分发。

推荐导入

from oxdls import OMEXML

当前更改(与python-bioformats相比)

  • TiffData - 这允许定义IFD(使用set_tiffdata_count(value)创建)(来自aicsimageio)
  • 已添加set_get_ExposureTime()函数
  • 为每个平面添加了X,Y,Z单位
  • 正方形ROI(必须先为每个ROI创建一个roiref,然后使用set_roi_count(value)创建ROI,然后对于每个ROI:ROI > 并集 > 矩形,其中可以设置ROI参数)
  • 进行了一些小的格式更改以提高一致性

项目详情


下载文件

下载适用于您平台的自定义文件。如果您不确定选择哪个,请了解更多关于 安装包 的信息。

源分发

omexml-dls-1.1.0.tar.gz (16.4 kB 查看哈希值)

上传时间

构建分发

omexml_dls-1.1.0-py3-none-any.whl (16.6 kB 查看哈希值)

上传时间 Python 3

支持