小不点

小不点是一个用于神经影像-临床数据集标准化组织和处理的轻量级框架。其目标是帮助用户采用FAIR原则，提高研究的可重复性。

该框架包括三个组件

1. 数据组织、管理和处理协议，包括以下步骤

   • 组织 原始数据，包括将原始DICOMs（或NIfTIs）转换为BIDS
   • 处理 使用现有或自定义管道进行成像数据处理
   • 跟踪 数据可用性和处理状态
   • 提取 成像衍生表型（IDPs）以进行下游统计分析

   

2. 一种数据集组织规范，通过提供关于表格数据（例如表型数据）和影像衍生物的附加指南来扩展脑影像数据结构（BIDS）标准。

   

3. 一个提供用户友好工具以应用框架的 命令行界面 和 Python 包。这些工具建立在现有的技术之上，如 Apptainer 容器平台 和 Boutiques 描述框架。支持多种现有的容器化管道，用户可以轻松添加新的管道。

   • 我们还开发了一个网络仪表板，用于交互式可视化影像和表型数据可用性。