基于 CUDA 的 Python 工具,用于高吞吐量 PET/MR 图像重建和分析
项目描述
NiftyPET: 高吞吐量图像重建和分析
文档: https://niftypet.readthedocs.io
NiftyPET 是一个软件平台,也是一个 Python 命名空间包,包含用于高通量 PET 图像重建、处理、分析和操作的子包,具有高定量精度和精度。下面是使用 NiftyPET 重建的图像描述,请参考。
NiftyPET 包含两个包
nimpa: https://github.com/NiftyPET/NIMPA (神经图像处理、分析和操作)
nipet: https://github.com/NiftyPET/NIPET (定量 PET 神经图像重建)
核心例程是用 CUDA C 编写的,并嵌入到 Python C 扩展中。该软件平台的科学方面在以下两篇开放获取出版物中有详细描述
NiftyPET:一种高通量软件平台,用于高定量精度和精度的 PET 成像和分析 Neuroinformatics (2018) 16:95. https://doi.org/10.1007/s12021-017-9352-y
快速处理 PET 列表模式数据以高效估计不确定性和数据分析 Physics in Medicine & Biology (2016). https://doi.org/10.1088/0031-9155/61/13/N322
致谢
该项目由伦敦大学学院(UCL)开发。最初,该项目得到了英国工程和物理科学研究委员会(EPSRC)的支持和资助。目前,该项目在以下资助下进一步发展
创新药物倡议2 联合企业,协议编号 No 115952。该联合企业得到了欧盟 地平线2020 研究和创新计划以及 EFPIA 的支持。
英国痴呆症平台 MR-PET 合作伙伴关系,由英国医学研究委员会(MRC)支持。
我们感谢 NVIDIA 公司 捐赠用于本研究的 Tesla K20 和 Titan X Pascal GPU 的支持。
版权 2018-21
Pawel J. Markiewicz @ 伦敦大学学院
Casper O. da Costa-Luis @ 伦敦国王学院
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