访问多种神经影像数据格式
项目描述
代码 |
|
测试 |
|
PyPI |
|
包 |
|
许可证 & DOI |
读取和写入常见的神经影像文件格式,包括:ANALYZE(纯文本、SPM99、SPM2及以后版本),GIFTI,NIfTI1,NIfTI2,CIFTI-2,MINC1,MINC2,AFNI BRIK/HEAD,ECAT 和 Philips PAR/REC。此外,NiBabel 还支持 FreeSurfer 的 MGH、几何、注释和形态计量文件,并对 DICOM 提供了一些有限的支持。
NiBabel 的 API 提供对标题信息(元数据)的完整或选择性访问,并通过 NumPy 数组提供图像数据。更多信息请参阅 NiBabel 的 文档网站 和 API 参考文档。
安装
要使用 pip 安装 NiBabel 的最新版本,请运行
pip install nibabel
要安装最新开发版本,请运行
pip install git+https://github.com/nipy/nibabel
当在 NiBabel 本身上工作时,安装“可编辑”模式可能很有用
git clone https://github.com/nipy/nibabel.git pip install -e ./nibabel
测试
在开发过程中,我们建议使用 tox 运行 nibabel 测试
git clone https://github.com/nipy/nibabel.git cd nibabel tox
要测试已安装的 nibabel 版本,请安装测试依赖项并运行 pytest
pip install nibabel[test] pytest --pyargs nibabel
有关更多信息,请参阅 开发者指南。
邮件列表
请将任何问题或建议发送至 neuroimaging 邮件列表。
许可证
NiBabel 在 MIT 许可证的条款下发布。NiBabel 中包含的一些代码在 BSD 许可证下发布。更多信息请参阅 COPYING 文件。
引用
项目详情
下载文件
下载适用于您平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解有关安装包的更多信息。
源分发
nibabel-5.2.1.tar.gz (4.5 MB 查看哈希值)
构建分发
nibabel-5.2.1-py3-none-any.whl (3.3 MB 查看哈希值)