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访问多种神经影像数据格式

项目描述

NiBabel logo

代码

PyPI - Python Version code style: blue imports: isort pre-commit

测试

stable tests codecov badge

PyPI

PyPI version PyPI - Downloads

Conda package Debian Unstable package Arch (AUR) Gentoo (::science) nixpkgs unstable

许可证 & DOI

License Zenodo DOI

读取和写入常见的神经影像文件格式,包括:ANALYZE(纯文本、SPM99、SPM2及以后版本),GIFTINIfTI1NIfTI2CIFTI-2MINC1MINC2AFNI BRIK/HEADECAT 和 Philips PAR/REC。此外,NiBabel 还支持 FreeSurfer 的 MGH、几何、注释和形态计量文件,并对 DICOM 提供了一些有限的支持。

NiBabel 的 API 提供对标题信息(元数据)的完整或选择性访问,并通过 NumPy 数组提供图像数据。更多信息请参阅 NiBabel 的 文档网站API 参考文档

安装

要使用 pip 安装 NiBabel 的最新版本,请运行

pip install nibabel

要安装最新开发版本,请运行

pip install git+https://github.com/nipy/nibabel

当在 NiBabel 本身上工作时,安装“可编辑”模式可能很有用

git clone https://github.com/nipy/nibabel.git
pip install -e ./nibabel

有关以前版本的信息,请参阅 版本存档开发变更日志

测试

在开发过程中,我们建议使用 tox 运行 nibabel 测试

git clone https://github.com/nipy/nibabel.git
cd nibabel
tox

要测试已安装的 nibabel 版本,请安装测试依赖项并运行 pytest

pip install nibabel[test]
pytest --pyargs nibabel

有关更多信息,请参阅 开发者指南

邮件列表

请将任何问题或建议发送至 neuroimaging 邮件列表

许可证

NiBabel 在 MIT 许可证的条款下发布。NiBabel 中包含的一些代码在 BSD 许可证下发布。更多信息请参阅 COPYING 文件。

引用

NiBabel 发布版在发布说明的顶部有 Zenodo 数字对象标识符(DOI)徽章。点击徽章获取更多信息。

项目详情


下载文件

下载适用于您平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解有关安装包的更多信息。

源分发

nibabel-5.2.1.tar.gz (4.5 MB 查看哈希值)

上传时间

构建分发

nibabel-5.2.1-py3-none-any.whl (3.3 MB 查看哈希值)

上传时间 Python 3

支持