一个用于安装Nextflow启动器的Python包装器
项目描述
Nextflow启动器Python包
描述
此包纯粹是Nextflow启动器(《https://nextflow.io/》)的安装程序,允许您轻松地将nextflow
命令行可用在您的系统上。
如何安装
- 使用
pip install nextflow
安装Nextflow启动器。 - 现在
nextflow
命令已在您的路径中。 - 运行
nextflow info
以强制它在第一次运行时下载所有依赖项(可选)。 - 现在您可以运行管道
nextflow run hello
。
要求
Nextflow启动器需要Java以及系统上可用的curl
或wget
,以便能够下载Nextflow Java依赖项并启动Nextflow。
注意
如果您在寻找此包的旧版本,该版本是Nextflow管道框架的包装器,允许您从Python代码运行管道,请检查nextflowpy
包。