基于先验知识和组学数据的网络推理和评估集成框架
项目描述
NetworkCommons - 连接网络推理领域中数据、方法和知识的桥梁
NetworkCommons是一个社区驱动的平台,旨在通过整合与上下文无关的先验知识与组学数据,简化访问特定上下文蛋白质相互作用网络的工具和资源。这些网络具有广泛的应用,从组学数据解释到识别药物靶点和关键驱动突变。
针对多个存储库中数据、方法和工具的复杂性和碎片化,NetworkCommons 提供了一个 API,该 API 提供了对原始和预处理组学数据的访问、有向和/或签名模板图以及各种网络推断方法的访问。通过简化访问性,我们旨在支持系统基准测试、增强关键评估并促进网络生物学的协作进步。
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贡献者
马丁·加里多-罗德里格斯,奥尔加·伊万诺娃,维克托·帕顿,丹尼斯·图雷
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