Genbank文件解析器。
项目描述
用法
>>> import nebgb >>> rec = nebgb.parse_file("./test/data/simple-1.gb").next() >>> rec.locus["name"] 'NP_034640' >>> rec.locus["length"] 182 >>> rec.keywords["source"]["name"] 'house mouse' >>> rec.features[1]["properties"]["product"] 'interferon beta, fibroblast' >>> for seq in rec.seqiter: ... print seq mnnrwilhaafllcfsttalsinykqlqlqertnirkcqelleqlngkinltyradfkip memtekmqksytafaiqemlqnvflvfrnnfsstgwnetivvrlldelhqqtvflktvle ekqeerltwemsstalhlksyywrvqrylklmkynsyawmvvraeifrnfliirrltrnf qn
或者您可以使用 nebgb.parse() 来解析Genbank文件的字符串或迭代器。
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nebgb-0.1.2.tar.gz的哈希值
算法 | 哈希摘要 | |
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SHA256 | 8f94fcc12d41e4f52110745edc9709c2cf2396dd559a94c4b931bb565f53ffd3 |
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MD5 | ca1040d5dc9eea9a94f483595aa354fa |
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BLAKE2b-256 | 0aefecf8d7608d700bec384f625812989ff990fcbf3c79569e8e083de6258804 |