ndx-franklab-novela NWB 扩展

关于

ndx-franklab-novela 是一个包含Loren Frank实验室的NWB自定义扩展的Python包。

如何安装

将ndx-franklab-novela添加到您的conda环境

pip install git+git://github.com/LorenFrankLab/ndx-franklab-novela

NovelaNeuro维护的原版扩展可以使用以下命令安装：

conda install -c conda-forge -c novelakrk ndx-franklab-novela

如何安装

将ndx-franklab-novela添加到您的conda环境
pip install git+git://github.com/LorenFrankLab/ndx-franklab-novela

NovelaNeuro维护的原版扩展可以使用以下命令安装：conda install -c conda-forge -c novelakrk ndx-franklab-novela

扩展

AssociatedFiles

NWB中关联文件的表示。

属性

• description string：关联文件的描述
• content string：关联文件的内容
• task_epochs string：描述关联文件的任务的epoch的id

HeaderDevice

NWB中HeaderDevice的表示。

属性

• headstage_serial string：来自header全局配置的头阶段序列号
• headstage_smart_ref_on string：来自header全局配置的头阶段智能参考开
• realtime_mode string：来自header全局配置的实时模式
• headstage_auto_settle_on string：来自header全局配置的头阶段自动调节开
• timestamp_at_creation string：来自header全局配置的创建时间戳
• controller_firmware_version string：来自header全局配置的控制器固件版本
• controller_serial string：来自header全局配置的控制器序列号
• save_displayed_chan_only string：来自header全局配置的仅保存显示通道
• headstage_firmware_version 字符串：来自全局配置头部的headstage_firmware_version
• qt_version 字符串：来自全局配置头部的qt_version
• compile_date 字符串：来自全局配置头部的compile_date
• compile_time 字符串：来自全局配置头部的compile_time
• file_prefix 字符串：来自全局配置头部的file_prefix
• headstage_gyro_sensor_on 字符串：来自全局配置头部的headstage_gyro_sensor_on
• headstage_mag_sensor_on 字符串：来自全局配置头部的headstage_mag_sensor_on
• trodes_version 字符串：来自全局配置头部的trodes_version
• headstage_accel_sensor_on 字符串：来自全局配置头部的headstage_accel_sensor_on
• commit_head 字符串：来自全局配置头部的commit_head
• system_time_at_creation 字符串：来自全局配置头部的system_time_at_creation
• file_path 字符串：来自全局配置头部的file_path

ShanksElectrode

NWB中shank电极的表示。

属性

• name 字符串：shank的名称
• rel_x 浮点数：此电极的rel_x值
• rel_y 浮点数：此电极的rel_y值
• rel_z 浮点数：此电极的rel_z值

Shank

NWB中shank的表示。

属性

• name 字符串：shank的名称
• shanks_electrodes 字典：shank中的电极

Probe

NWB中探针的表示。

属性

• id 整数：探针的唯一ID
• probe_type 字符串：探针的类型
• units 字符串：设备中的单位
• probe_description 字符串：探针的描述
• contact_side_numbering 布尔值：是否启用contact_side_numbering
• contact_size 浮点数：接触尺寸的浮点数值
• shanks 字典：探针中的shanks

DataAcqDevice

NWB中数据采集设备的表示。

属性

• system 字符串：设备的系统
• amplifier 字符串：放大器（可选）
• adc_circuit 字符串：adc_circuit（可选）

CameraDevice

NWB中相机设备的表示。

属性

• meters_per_pixel 浮点数：每像素的米数
• model 字符串：此相机设备的型号
• lens 字符串：此相机中的镜头信息
• camera_name 字符串：此相机的名称

此扩展使用 ndx-template 创建。