从Conda-Store启动Jupyter内核
项目描述
nb_conda_store_kernels
此扩展使Jupyter Notebook或JupyterLab应用能够访问存储在Conda-Store中的环境,并运行Python、R和其他语言的内核。当选择来自外部环境的内核时,将下载、提取环境,自动激活conda环境,并最终启动内核。此包受到了nb_conda_kernels的极大启发。
通过nb_conda_store_kernel
内核启动的任何笔记本都将包含有关使用环境的笔记本元数据。这提供了一种强大的机制,可以在以后以可重复的方式运行笔记本。
{
...,
"kernelspec": {
...,
"name": "conda-store://<namespace>/<environment_name>:<build-id>",
...,
},
...
}
该包通过定义一个自定义KernelSpecManager来工作,该Manager调用Conda-Store REST API以获取具有所需软件包的可用conda环境。它动态修改每个KernelSpec,以便可以从笔记本环境正确运行。当您创建一个新的笔记本时,这些修改过的内核将在选择列表中可用。另外,无需Conda-Pack
用法
此包不需要pip
或conda
来正常运行,但目前仅适用于Linux。它应安装在你运行Jupyter Notebook或JupyterLab的环境中。建议通过Conda安装nb_conda_store_kernsl
,因为激活钩子可以简化安装过程,但没有强烈理由要使用Conda。
conda install -c conda-forge nb_conda_store_kernels
或者,pip
也可以正常工作,但需要多一步操作。
pip install nb_conda_store_kernels
python -m nb_conda_store_kernels.install --enable
# python -m nb_conda_store_kernels.install --disable # to disable
python -m nb_conda_store_kernels.install --enable
仅修改单个Jupyter设置。如果不起作用(应该起作用,如果不起作用则是一个错误)您需要将以下设置添加到jupyter_config.py
中。
mkdir ~/.jupyter
echo 'c.JupyterApp.kernel_spec_manager_class = "nb_conda_store_kernels.manager.CondaStoreKernelSpecManager"' > ~/.jupyter/jupyter_conifg.py
为了使nb_conda_store_kernels
能够正确连接到Conda-Store,需要设置几个环境变量。在底层,使用的是conda-store
客户端,并且有详细的配置文档。
export CONDA_STORE_URL=http(s)://...
export CONDA_STORE_AUTH=none|basic|token
# export CONDA_STORE_USERNAME=... # using basic auth
# export CONDA_STORE_PASSWORD=... # using basic auth
# export CONDA_STORE_TOKEN=... # using token auth
最后启动JupyterLab!
jupyter lab
连接到现有的Conda-Store服务器
访问您使用的Conda-Store服务器,并在登录后通过访问/user
端点来获取您的用户令牌。
docker run -p 8888:8888 -e CONDA_STORE_TOKEN=... quansight/nb-conda-store-kernels:v0.1.5
与nbconvert、voila、papermill等一起使用。
由于nb_conda_store_kernels
在幕后使用的是conda-store
客户端,并且设置了适当的环境变量,因此这些用例得到了客户端的支持。计划扩展其他工具以使用Conda-Store。
conda-store run namespace/environment -- python -c "print('Hello, Conda-Store!')"
开发
启动Conda-Store服务器
docker-compose up --build
jupyter lab
在localhost:5000登录Conda-Store并创建一个新的环境。
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源代码分发
nb_conda_store_kernels-0.1.5.tar.gz的散列值
算法 | 散列摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | 4c4d19a16c1ed338633d11785a8857c0ba597ee5e6d7e1383d7bbfda1fdf1886 |
|
MD5 | 01fe850fa52948376ffceb4184f5cd7d |
|
BLAKE2b-256 | 7588d9dd3b27fabbd6034e09f32515ea52bb01c6d3a6be2aeae10a1b1f74c3ce |