mygfa

这是一个简单的Python库，用于解析、操作和生成GFA格式的全景基因组图。它优先考虑简洁和清晰，而不是性能和功能。

如example.py所示，这是计算GFA文件的节点深度的样子

import mygfa
import sys
graph = mygfa.Graph.parse(sys.stdin)
seg_depths = {name: 0 for name in graph.segments}
for path in graph.paths.values():
    for step in path.segments:
        seg_depths[step.name] += 1

输入pip install mygfa开始使用。