NCATS翻译器mvp-module-library

国家转化科学中心（NCATS）资助了一个名为“翻译器”的项目，旨在开发生物医学知识集成的网络基础设施。

一个关键目标是开发一个平台，用于指定和运行连接不同生物医学数据类型（疾病、基因、药物）的计算工作流程，以确定各种医疗条件的治疗新选择。为此目标做出贡献的是一套生物信息学模块，这些模块作为此类工作流程的构建块。其中一些模块已汇总并在此包中发布，以便在项目的“最小可行产品”应用中重复使用。

安装

此软件包已发布在PyPI（https://pypi.ac.cn/project/mvp-module-library/）上，并可以使用pip进行安装

pip install mvp-module-library

与以往一样，为您的项目使用单独的Python虚拟环境很有用

virtualenv -p python3.6 venv
source venv/bin/activate
pip install mvp-module-library

用法示例

>>> from pprint import pprint
>>> from biolink_api.biolink_client import BioLinkApiWrapper
>>> b = BioLinkApiWrapper()
>>> pprint(b.get_obj('MONDO:0005148'))
{'association_counts': None,
 'categories': ['disease'],
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 'deprecated': None,
 'description': 'A type of diabetes mellitus that is characterized by insulin '
                'resistance or desensitization and increased blood glucose '
                'levels. This is a chronic disease that can develop gradually '
                'over the life of a patient and can be linked to both '
                'environmental factors and heredity.',
 'id': 'MONDO:0005148',
 'label': 'type 2 diabetes mellitus',
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 'synonyms': [{'pred': 'synonym', 'val': 'adult-onset diabetes', 'xrefs': None},
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