用于评估脑部结构(T1w,T2w)和功能性MRI的自动质量控制和可视化报告。
项目描述
MRIQC从结构(T1w和T2w)和功能MRI(磁共振成像)数据中提取无参考图像质量指标(IQMs)。
MRIQC是一个开源项目,遵循以下软件开发原则
模块化和可集成性:MRIQC实现了一个nipype工作流程,以集成依赖第三方软件工具箱(如ANTs和AFNI)的模块化子工作流程。
最小预处理:MRIQC工作流程应该尽可能最小,以便在原始数据或其最小预处理衍生物上估计IQMs。
互操作性和标准:MRIQC遵循脑成像数据结构(BIDS),并采用BIDS-App标准。
可靠性和鲁棒性:该软件通过使用来自OpenfMRI的图像测试其对抗数据变异性的鲁棒性(采集参数、生理差异等),并使用CircleCI永久检查和维持其可靠性。
引用
支持和通信
此项目的文档可在以下位置找到:https://mriqc.readthedocs.io/。
用户可以使用mriqc-users google group获取帮助。
可以在此处提交此软件的所有错误、问题和增强请求:https://github.com/nipreps/mriqc/issues。
开发
可以从此存储库的根目录运行此命令来构建基于最新MRIQC Docker构建的本地开发构建
docker build -f Dockerfile_devel -t mriqc_devel .
要测试更改,需要将本地源代码挂载到开发容器中
docker run --rm -v .:/src/mriqc mriqc_devel
可以在pyproject.toml中的dependencies下添加新的Python依赖项。每次更改或添加依赖项时,都需要使用上述docker build命令重新构建Docker镜像。
许可证信息
MRIQC遵守NiPreps框架的通用许可指南。
MRIQC最初源于,因此受到PCP质量评估协议的严重影响。请查看NOTICE文件以获取更多信息。
许可证
版权(c)2021,NiPreps开发者。
截至 21.0.x 预发布和发布系列,MRIQC 采用 Apache 许可证 2.0 版(以下简称“许可证”);除非适用法律要求或经书面同意,否则不得使用此文件,除非遵守许可证。您可以在 https://apache.ac.cn/licenses/LICENSE-2.0 获取许可证副本。
除非适用法律要求或经书面同意,否则在许可证下分发的软件按“原样”基础分发,不提供任何形式的保证或条件,无论是明示的还是隐含的。有关许可证的权限和限制的具体语言,请参阅许可证。
致谢
本作品由 NiPreps 社区 指导和维护。本资源的开发得到了 Laura 和 John Arnold 基金会(RAP 和 KJG)、NIBIB(R01EB020740、SSG;1P41EB019936-01A1SSG、YOH)、NIMH(RF1MH121867、RAP、OE;R24MH114705 和 R24MH117179、RAP;1RF1MH121885 SSG)、NINDS(U01NS103780、RAP)和 NSF(CRCNS 1912266、YOH)的支持。OE 感谢 SNSF Ambizione 项目“利用 MRI 揭示大脑连接结构、功能和动态的相互作用”(资助编号 PZ00P2_185872)的财政支持。
项目详情
下载文件
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源代码分发
构建分发
mriqc-24.0.2.tar.gz 的哈希值
算法 | 哈希摘要 | |
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SHA256 | 1f864dbfd74ecc8d1b185fe7db8afb0a5d4d9a107fbc91df66eeff30ef7ec7ed |
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MD5 | 6e0fa20e6ef3ec63af93cd0cd2fe0768 |
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BLAKE2b-256 | dc6bc9f999145175c1f3cc245311747a3817fb31f0d2b75dd1749bbb677f75df |
mriqc-24.0.2-py3-none-any.whl 的哈希值
算法 | 哈希摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | 225946628531218589538bf38c7cc67cb21e614671f31a3ae64d24750ddcf348 |
|
MD5 | 08b54d6cedc1a70d1530f36c61d5c123 |
|
BLAKE2b-256 | 7fe9579d4c4aa43f89c2a4fadbc629a67b3c3c54c94d50382074de4dd504b141 |