MQ²旨在从MapQTL输出中提取和查找QTLs
项目描述
一个简单的Python模块，用于处理来自QTL绘图工具（包括MapQTL和R/qtl）的输出。
假设每个连锁群有一个QTL，并使用用户设置的LOD阈值。此应用程序提取QTL绘图工具检测到的所有QTL，找到最近的标记，并将每个标记发现的QTL数量放在遗传图上。
这种方法可以快速帮助您在数据集中找到潜在的QTL热点。这对于大量性状的大型QTL分析尤其有用。
获取此项目
发布：http://pypi.python.org/packages/source/M/MQ2/MQ2-1.0.0.tar.gz
在以下网站上运行：http://www.plantbreeding.nl/mq2
依赖项
xlrd（仅由Excel插件需要，如果没有，则仅此插件受到影响）
文档
项目包含有关如何安装、运行和为此项目做出贡献的文档。
文档可以在以下位置找到： - 在线：https://github.com/PBR/MQ2/tree/master/doc - 作为PDF：https://github.com/PBR/MQ2/tree/master/MQ2_doc.pdf?raw=true
运行项目
要运行项目，只需运行提供的 MQ2 脚本。
查看 MQ2 --help 或 MQ2 -h 了解可用的不同参数。
测试
该项目包含单元测试，允许您检查代码是否按预期运行。
要运行它们，有两种方式，要么
./runtest.sh
要么
python setup.py nosetest
许可证
此项目采用 GPLv3+ 许可。
关闭
MQ2-1.1.0.tar.gz 的散列
| 算法 | 散列摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | fbe4b6556bbfe720a24d722c516b2c8b087b0612285906e44c111ba73ef7e441 |
|
| MD5 | 676c6dbb33f58986e67d42baddb2ca99 |
|
| BLAKE2b-256 | a03d912247cb8dccbd3952a1ddb59eb4444226729261c9fa34d834e2ec202c16 |