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MoClo系统逻辑的Python实现。

项目描述

MoClo 系统逻辑 的Python实现。

Source PyPI Travis Docs Codecov Codacy Format License

需求

biopython

序列处理

PyPI biopython

Source biopython

License biopython

cached-property

懒正则表达式评估

PyPI cached-property

Source cached-property

License cached-property

six

Python 2/3兼容性

PyPI six

Source six

License six

安装

此软件包可作为wheel提供,并可以使用pip进行安装

$ pip install --user moclo

要查看更多安装方法,请访问在线文档的安装页面。

工具包

单独的moClo并不是很有用。为了能够模拟MoClo组装,您可以安装以下工具包之一

  • moclo-ytk:MoClo酵母工具包,John Dueber实验室和Pichia工具包,Volker Sieber实验室

  • moclo-cidar: MoClo CIDAR试剂盒,Douglas Densmore实验室

  • moclo-ecoflex: MoClo EcoFlex,Paul Freemont实验室

  • moclo-ig: Icon Genetics MoClo,Sylvestre Marillonnet实验室

  • moclo-gb3: Golden Braid 3.0,Diego Orzaez实验室

工具包包含MoClo逻辑的具体实现(使用参考论文中的DNA标记和限制性内切酶),以及从AddGene获得并手动注释的官方序列。这些序列可以通过使用registry接口的moclo.registry模块访问。

关于

本库遵循MIT许可协议。它是在2018年夏天在巴黎巴斯德研究所的InBio团队实习期间开发的。

项目详情


下载文件

下载适用于您平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解更多关于安装包的信息。

源代码分发

moclo-0.4.7.zip (31.8 kB 查看哈希值)

上传时间 源代码

构建分发

moclo-0.4.7-py2.py3-none-any.whl (24.2 kB 查看哈希值)

上传时间 Python 2 Python 3

支持者:

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