miniwdl + GWFCore + SageMaker Studio

此存储库是部署 miniwdl-aws 和 GWFCore 以在 Amazon SageMaker Studio 中使用的配方，Amazon SageMaker Studio 是一个带有终端和文件系统浏览器的网络IDE。您可以使用终端在 GWFCore 的 AWS Batch 栈上运行 miniwdl run，使用文件系统浏览器管理 EFS 上的输入和输出，并使用 Jupyter 笔记本进一步分析输出。

CDK样板

文件 cdk.json 告诉 CDK 工具包如何执行您的应用程序。

此项目设置类似于标准的 Python 项目。初始化过程还会在此项目中创建一个虚拟环境，存储在 .venv 目录下。为了创建虚拟环境，它假设您的路径中有一个可访问 venv 包的 python3（或 Windows 上的 python）。如果由于任何原因自动创建虚拟环境失败，您可以手动创建虚拟环境。

在 MacOS 和 Linux 上手动创建虚拟环境

$ python3 -m venv .venv

初始化过程完成后创建虚拟环境后，您可以使用以下步骤激活您的虚拟环境。

$ source .venv/bin/activate

如果您是 Windows 平台，您将像这样激活虚拟环境

% .venv\Scripts\activate.bat

激活虚拟环境后，您可以安装所需的依赖项。

$ pip install -r requirements.txt

在此阶段，您可以现在生成此代码的 CloudFormation 模板。

$ cdk synth

要添加其他依赖项，例如其他 CDK 库，只需将它们添加到您的 setup.py 文件中，然后重新运行 pip install -r requirements.txt 命令。

有用命令

• cdk ls 列出应用程序中的所有堆栈
• cdk synth 生成 CloudFormation 模板
• cdk deploy 将此堆栈部署到您的默认 AWS 账户/区域
• cdk diff 比较已部署的堆栈与当前状态
• cdk docs 打开 CDK 文档

享受！