microscopestitching 0.2.0

概述

此软件旨在成为一种可靠的方式来拼接您的显微镜图像。为了获得良好的结果，您的数据集应满足以下假设

• 图像是规则间距的

• 图像大小相同

• 并排图像只在一个维度上具有平移

• (如果不是，请检查您的扫描镜旋转)

• 图像边缘的缩放是恒定的

安装

使用 pip… 安装

pip install microscopestitching

示例

from microscopestitching import stitch
from skimage.io import imsave

images = []
for i in range(50):
    row = i // 10
    col = i % 10
    images.append(('%d.png' % i, row, col))

merged = stitch(images)
imsave('merged.png', merged)

请参阅 笔记本示例。

API参考

API参考在 http://microscopestitching.rtfd.org。

开发

安装依赖项并将microscopestitching的开发版本链接到pip

git clone https://github.com/arve0/microscopestitching
cd microscopestitching
pip install -r requirements.txt # install dependencies and microscopestitching-package

tox

pip install -r docs/requirements.txt
make docs