用于协调MHub模型输入和输出数据的粘合层框架。
项目描述
# mhubio - 粘合层模块
mhubio框架提供了一些模块,用于导入、转换和组织医学文件。由于相同模态(例如,CT扫描作为输入,分割作为输出)的输入和输出在文件系统级别存储结构和文件格式(dicom、nifti、nrrd)上可能存在很大差异,因此该框架中的模块允许轻松适应多个模型之间定义良好和标准化的I/O框架。一个关键概念是模型管道本身不需要改变。相反,使用转换和组织模块提供模型管道创建所需的数据格式。处理多个患者、文件、格式和中间步骤可能会迅速使结构良好的代码因文件系统操作而超载,使得代码难以被外部读者理解。因此,mhubio内部跟踪文件管理。mhubio管道是模块的顺序流,每个模块都检索和传递数据。然后,不是通过它们的相对或绝对路径请求文件,而是通过模态和格式。
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