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Python工具包,用于多电极阵列(MEA)的细胞外电生理记录的生物物理模拟

项目描述

Build Status PyPI version

MEArec:用于多电极阵列(MEA)的快速可定制细胞外记录的生物物理模拟

MEArec是一个用于生成多电极阵列(MEA)上的生物物理细胞外神经记录的软件包。记录生成结合了细胞外动作电位(EAP)模板生成和 spikes trains 生成。记录通过卷积和调制 EAP 模板与 spikes trains 以及添加噪声来构建。

要克隆此存储库,请打开您的终端并运行

git clone https://github.com/SpikeInterface/MEArec.git

安装

可以使用以下方法安装MEArec包

pip install MEArec

要从源安装,请在克隆的文件夹中运行此命令

pip install -e .

文档

MEArec的详细文档在这里: https://mearec.readthedocs.io/en/latest/

参考

有关更多信息,请参阅开放获取神经信息学文章: https://doi.org/10.1007/s12021-020-09467-7

如果您使用此软件,请引用

@article{buccino2020mearec,
  title={Mearec: a fast and customizable testbench simulator for ground-truth extracellular spiking activity},
  author={Buccino, Alessio Paolo and Einevoll, Gaute Tomas},
  journal={Neuroinformatics},
  pages={1--20},
  year={2020},
  publisher={Springer}
}

项目细节


下载文件

下载适用于您平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解有关安装包的更多信息。

源分布

MEArec-1.9.1.tar.gz (3.2 MB 查看哈希值)

上传时间

构建分布

MEArec-1.9.1-py3-none-any.whl (3.6 MB 查看哈希值)

上传时间 Python 3

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