Python工具包,用于多电极阵列(MEA)的细胞外电生理记录的生物物理模拟
项目描述
MEArec:用于多电极阵列(MEA)的快速可定制细胞外记录的生物物理模拟
MEArec是一个用于生成多电极阵列(MEA)上的生物物理细胞外神经记录的软件包。记录生成结合了细胞外动作电位(EAP)模板生成和 spikes trains 生成。记录通过卷积和调制 EAP 模板与 spikes trains 以及添加噪声来构建。
要克隆此存储库,请打开您的终端并运行
git clone https://github.com/SpikeInterface/MEArec.git
安装
可以使用以下方法安装MEArec包
pip install MEArec
要从源安装,请在克隆的文件夹中运行此命令
pip install -e .
文档
MEArec的详细文档在这里: https://mearec.readthedocs.io/en/latest/
参考
有关更多信息,请参阅开放获取神经信息学文章: https://doi.org/10.1007/s12021-020-09467-7
如果您使用此软件,请引用
@article{buccino2020mearec,
title={Mearec: a fast and customizable testbench simulator for ground-truth extracellular spiking activity},
author={Buccino, Alessio Paolo and Einevoll, Gaute Tomas},
journal={Neuroinformatics},
pages={1--20},
year={2020},
publisher={Springer}
}
项目细节
下载文件
下载适用于您平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解有关安装包的更多信息。
源分布
MEArec-1.9.1.tar.gz (3.2 MB 查看哈希值)
构建分布
MEArec-1.9.1-py3-none-any.whl (3.6 MB 查看哈希值)