分子数据集成重叠比较软件。
项目描述
mdaencore
最新版本 | |
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状态 | |
社区 |
分子数据集成重叠比较软件。
mdaencore 受限于行为准则。
安装
要从源代码构建 mdaencore,我们强烈建议使用虚拟环境。如果可能的话,我们强烈建议您使用 Anaconda 作为您的包管理器。以下我们提供了针对 conda
和 pip
的说明。
使用 conda
确保您已安装 conda。使用以下命令在您首选的 conda 环境中安装:
conda install -c conda-forge mdaencore
更新
conda update -c conda-forge mdaencore
使用 pip
要从源代码构建包,运行
pip install .
如果您想创建一个开发环境,使用以下命令安装测试和文档所需的依赖项:
pip install -e ".[test,doc]"
版权
mdaencore 源代码托管在 https://github.com/MDAnalysis/mdaencore,并按照 GNU 通用公共许可证第 2 版或任何更新版本(参见文件 LICENSE)提供。
请注意,代码是根据GNU 通用公共许可证第 3 版或任何更新版本打包和发布的。
版权(c)2023,mdaencore 作者(见文件 AUTHORS.md)
致谢
本项目基于 MDAnalysis Cookiecutter 版本 0.1。当您在已发表的论文中使用 mdaencore 时,请引用 MDAnalysis 和 ENCORE 论文。
- M. Tiberti, E. Papaleo, T. Bengtsen, W. Boomsma, and K. Lindorff-Larsen. ENCORE: Software for quantitative ensemble comparison. PLoS Comput Biol, 11 (2015), e1004415. doi: 10.1371/journal.pcbi.1004415
- R. J. Gowers, M. Linke, J. Barnoud, T. J. E. Reddy, M. N. Melo, S. L. Seyler, D. L. Dotson, J. Domanski, S. Buchoux, I. M. Kenney, and O. Beckstein. MDAnalysis: A Python package for the rapid analysis of molecular dynamics simulations. In S. Benthall and S. Rostrup, editors, Proceedings of the 15th Python in Science Conference, pages 98-105, Austin, TX, 2016. SciPy. doi:10.25080/Majora-629e541a-00e
项目详情
下载文件
下载适合您平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解有关安装包的更多信息。
源代码分发
mdaencore-1.0.0.tar.gz (285.6 kB 查看哈希值)
构建分发
mdaencore-1.0.0-cp311-cp311-win_amd64.whl (391.9 kB 查看哈希值)
mdaencore-1.0.0-cp310-cp310-win_amd64.whl (390.9 kB 查看哈希值)
mdaencore-1.0.0-cp39-cp39-win_amd64.whl (390.9 kB 查看哈希值)
关闭
mdaencore-1.0.0.tar.gz的哈希值
算法 | 哈希摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | ba34144b441cdfc0d04d7e079edd8318e8b8035671ac11df84140345957d6e91 |
|
MD5 | 11d311bd9d9f649c1bfdcdf50e9ea8f8 |
|
BLAKE2b-256 | 019830d0017c10d21e978dfe0f342ed39c9b5f5002ef03150caeafa755e8c819 |
关闭
mdaencore-1.0.0-cp311-cp311-win_amd64.whl的哈希值
算法 | 哈希摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | a19ea152b2af2f054ee2874692272bac8295cb95c28ed63ee8ef0f698f8cb7a3 |
|
MD5 | 2a56426757000ec028a45b1e550e4e6f |
|
BLAKE2b-256 | ec255205d95c3c446ef33ef4f249362d3fc1a0750691335065b748a1f123f845 |
关闭
哈希值 用于 mdaencore-1.0.0-cp311-cp311-manylinux_2_17_x86_64.manylinux2014_x86_64.whl
算法 | 哈希摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | 269199beaadfbe59d0bb4f65f66ed1479cb630ec4d0599f658b29089f8f4c354 |
|
MD5 | becded0d79a70587f54d3282022d1d54 |
|
BLAKE2b-256 | 679185f5e74e7e297dfd998ee22dde277ee031776acab10d27f3ee93f7945aec |
关闭
哈希值 用于 mdaencore-1.0.0-cp311-cp311-macosx_10_9_x86_64.whl
算法 | 哈希摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | 6ceed2c250aab9d606b390dace15a0bca064f29ec472b9e916881d1a41a12862 |
|
MD5 | 16d0feebed8c9075af3771d92ad51d7a |
|
BLAKE2b-256 | b52f28c1e520819ccf56d0cedc4272ec94a4dfa5a514b92347758701ac0f1ad8 |
关闭
哈希值 用于 mdaencore-1.0.0-cp310-cp310-manylinux_2_17_x86_64.manylinux2014_x86_64.whl
算法 | 哈希摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | dbafc524b6b690ffdb482c44eb91f510fde499aa40357ba81a481138b5211eef |
|
MD5 | 4d8128e8cb0a11ea4c10c1d9b24ac774 |
|
BLAKE2b-256 | 9d1e27b5098536d7510cc631ca9e6b0f3d3dae8894eaa6b759671ceda6bb4027 |
关闭
哈希值 用于 mdaencore-1.0.0-cp310-cp310-macosx_10_9_x86_64.whl
算法 | 哈希摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | a8855bd3e73f57b2df8c45469506cf2d6f19b3a1578d6e52e83f04dcda4be494 |
|
MD5 | ba2ab79ef4d14a1198ca53394f77d636 |
|
BLAKE2b-256 | 39670fc3c19b4be2ae2e64c8ec4d27704816d699ca7951374b3fef44416db761 |
关闭
哈希值 用于 mdaencore-1.0.0-cp39-cp39-manylinux_2_17_x86_64.manylinux2014_x86_64.whl
算法 | 哈希摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | cce5f3d19db7ad90e4563150a6d07ce8cdf9519552dfb9edb85caa50d00633f0 |
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MD5 | 8e7635a52b736511049e61a18d6974d1 |
|
BLAKE2b-256 | a0b8d9f1b0f4272a21c7e6763119293e544e7e1f7e9f1955d89cc916361ee739 |
关闭
哈希值 用于 mdaencore-1.0.0-cp39-cp39-macosx_10_9_x86_64.whl
算法 | 哈希摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | baa37db9aa47ad2df85c99601d4618aacba9125b4f076ff4d369f2073813b7b1 |
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MD5 | 3dc783eb500b4c16ba931b78fcd58ef0 |
|
BLAKE2b-256 | 3ba5ca7508134a8cbfcc3f1b6f35b88fcf6522c342b6e227017d90ebab35266c |