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分子数据集成重叠比较软件。

项目描述

mdaencore

最新版本 Last release tag GitHub commits since latest release (by date) for a branch Documentation Status Anaconda-Server Badge
状态 GH Actions Status codecov
社区 License: GPL v2 Powered by MDAnalysis

分子数据集成重叠比较软件。

mdaencore 受限于行为准则

安装

要从源代码构建 mdaencore,我们强烈建议使用虚拟环境。如果可能的话,我们强烈建议您使用 Anaconda 作为您的包管理器。以下我们提供了针对 condapip 的说明。

使用 conda

确保您已安装 conda。使用以下命令在您首选的 conda 环境中安装:

conda install -c conda-forge mdaencore

更新

conda update -c conda-forge mdaencore

使用 pip

要从源代码构建包,运行

pip install .

如果您想创建一个开发环境,使用以下命令安装测试和文档所需的依赖项:

pip install -e ".[test,doc]"

版权

mdaencore 源代码托管在 https://github.com/MDAnalysis/mdaencore,并按照 GNU 通用公共许可证第 2 版或任何更新版本(参见文件 LICENSE)提供。

请注意,代码是根据GNU 通用公共许可证第 3 版或任何更新版本打包和发布的。

版权(c)2023,mdaencore 作者(见文件 AUTHORS.md

致谢

本项目基于 MDAnalysis Cookiecutter 版本 0.1。当您在已发表的论文中使用 mdaencore 时,请引用 MDAnalysisENCORE 论文

  1. M. Tiberti, E. Papaleo, T. Bengtsen, W. Boomsma, and K. Lindorff-Larsen. ENCORE: Software for quantitative ensemble comparison. PLoS Comput Biol, 11 (2015), e1004415. doi: 10.1371/journal.pcbi.1004415
  2. R. J. Gowers, M. Linke, J. Barnoud, T. J. E. Reddy, M. N. Melo, S. L. Seyler, D. L. Dotson, J. Domanski, S. Buchoux, I. M. Kenney, and O. Beckstein. MDAnalysis: A Python package for the rapid analysis of molecular dynamics simulations. In S. Benthall and S. Rostrup, editors, Proceedings of the 15th Python in Science Conference, pages 98-105, Austin, TX, 2016. SciPy. doi:10.25080/Majora-629e541a-00e

项目详情


下载文件

下载适合您平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解有关安装包的更多信息。

源代码分发

mdaencore-1.0.0.tar.gz (285.6 kB 查看哈希值)

上传时间 源代码

构建分发

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上传于 CPython 3.11 macOS 10.9+ x86-64

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上传于 CPython 3.9 Windows x86-64

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上传于 CPython 3.9 manylinux: glibc 2.17+ x86-64

mdaencore-1.0.0-cp39-cp39-macosx_10_9_x86_64.whl (393.2 kB 查看哈希值)

上传于 CPython 3.9 macOS 10.9+ x86-64

支持者:

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