manage_crystal

一个用于将crystal文件（原子坐标 + 单胞）转换为常用文件并提取一些有用信息的工具

安装

pip install manage_crystal

使用

• 以获取晶体的默认信息

$ manage_crystal.py inputfilename.inputformat [options]`

• 转换为其他格式

$ manage_crystal.py inputfilename.inputformat [options] -o outputfilename.outputformat

或者

$ manage_crystal.py inputfilename.inputformat [options] -o outputformat

• 获取帮助并探索功能

$ manage_crystal.py --help

• 在Python脚本中转换文件

from manage_crystal.utils import parse_and_write
parse_and_write(inputfile, outputfile)

提示

• 您可能想使用-silent来抑制默认的详细输出：多个选项“跳过 -silent”，这样您就可以仅将信息打印到屏幕上（例如，-printatoms -silent仅在屏幕上打印一行原子类型）。这使得使用bash循环处理结构列表变得容易。

开发

以可编辑模式安装manage_crystal，并启用每次提交的自动代码格式化

git clone https://github.com/danieleongari/manage_crystal.git
cd manage_crystal
pip install -e .\[pre-commit\]
pre-commit install