MaBoSS软件的Python和Jupyter API
项目描述
pyMaBoSS
pyMaBoSS是MaBoSS软件的Python API。它可以在Colomoto docker内部使用。API通过在Python中运行以下行加载：
import maboss
加载后，它允许您快速加载MaBoSS模型
sim = maboss.load("metastasis.bnd", "metastasis.cfg")
然后模拟模型并绘制模拟结果
res = sim.run() res.plot_piechart()
安装说明
pyMaBoSS可以通过Conda、PyPi或GitHub安装。
使用Conda安装
这是推荐选项，因为它还可以简单地安装所有依赖项。
conda -c colomoto install pymaboss
这将安装库，并已准备好使用。
使用PyPi安装
这不是推荐选项，因为它还不能打包MaBoSS的二进制文件，但如果您已经安装了MaBoSS，则可以使用以下命令安装pyMaBoSS：
pip安装maboss
如果您有conda，并且使用Linux或macosx，可以运行：
python -m maboss-setup
否则，您可以使用以下链接下载，对于Linux、MacOSX或Windows。下载后，您需要解压缩并将它们放在配置在您的PATH中的文件夹中，以便使它们可访问。
使用GitHub安装
最后，您也可以直接从官方GitHub仓库安装pyMaBoSS：
git clone https://github.com/colomoto/pyMaBoSS
cd pyMaBoSS
python setup.py install
请注意，这也包含了没有 MaBoSS 二进制文件，因此要安装它们，您需要遵循上述步骤。
下载文件
下载适用于您平台的文件。如果您不确定选择哪个，请了解更多关于 安装包 的信息。
源代码分发
maboss-0.8.9.tar.gz (76.8 kB 查看散列)
构建分发
maboss-0.8.9-py3-none-any.whl (74.7 kB 查看散列)
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maboss-0.8.9.tar.gz 的散列
| 算法 | 散列摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 999bf289620371fd8391222c6c76b880b459d0bf7125fea185af934b38bbfbaf |
|
| MD5 | 9c4e7a4e9aa7f0961615a0f0406fec48 |
|
| BLAKE2b-256 | 69a66a307b0ed5a0ec200abf86c4d785f088fd32e16ca42e956f5bdb06c52b5b |
关闭
maboss-0.8.9-py3-none-any.whl 的散列
| 算法 | 散列摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 571e2bb0a02e51c32639be0cc3e7fb42fa482c644dc70184feb1930c5e14f972 |
|
| MD5 | d66704f6f488d18b8ee36cf875f32374 |
|
| BLAKE2b-256 | bdd4e94080591d961e8865e9124665fc3b70127a20769b5a1490ee98a5964afe |
