使用混合模型的遗传分析工具箱
项目描述
limix
基因组分析需要灵活的模型，这些模型可以适应用户的需求。
Limix是一个灵活且高效的线性混合模型库，具有Python接口。它包括以下方法：
- 单变体关联和交互测试
- 使用线性混合模型的方差分解分析
- 关联和交互集测试
- 用于统计分析、基本i/o和绘图的不同的实用工具。
我们对库有广泛的 文档。如果您需要进一步的帮助或想讨论有关limix的任何事情，请加入我们的 论坛 💬 并与我们聊天 😃。如果您发现了一个错误，请通过创建 问题 来报告。
安装
注意：我们将维护limix 2.0.x一段时间，以防您在limix 3.0.x中找不到某些功能。如果是这种情况，请务必在您的终端中输入
pip install "limix <3,>=2"。
安装简单，适用于macOS、Linux和Windows
pip install limix
如果您已经安装了Limix，但想将其升级到最新版本
pip install limix --upgrade
交互式教程
- eQTL（需要limix 2.0.x）
- Struct-LMM（需要limix 2.0.x）
运行测试
安装后，您可以使用
python -c "import limix; limix.test()"
只要您有 pytest。
作者
许可
本项目遵循Apache许可证。
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limix-3.0.4.tar.gz的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 9e32e82c18d66676c1d3c47c045b535f2064dba5bebafcd4036d1e01ef63d98a |
|
| MD5 | aa8f8858c5bf4e0195eda7e95f73af91 |
|
| BLAKE2b-256 | d668f878f7879c772016ebea618255a781408d057aec0f06673f7a8e5909344c |
