处理莱卡矩阵筛选器实验图像。
项目描述
leicaimage
源代码: https://github.com/MartinHjelmare/leicaimage
处理莱卡矩阵筛选器实验图像。
leicaimage库是leicaexperiment库的修改版本,作为该库的替代品构建,但不包含任何xml或图像处理。这也使得leicaimage在没有重依赖的情况下工作。
概述
这是一个用于与莱卡LAS AF/X矩阵筛选器实验接口的Python模块。
该模块可用于
- 根据属性(如
- 幻灯片(S)
- 井位置(U,V)
- 字段位置(X, Y)
- z栈位置(Z)
- 通道(C)
安装
通过pip(或您喜欢的包管理器)安装此软件
pip安装leicaimage
用法
访问所有图像
from leicaimage import Experiment
experiment = Experiment('path/to/experiment--')
for image in experiment.images:
...
访问特定的井/字段
from leicaimage import Experiment
experiment = Experiment('path/to/experiment--')
# on images in well --U00--V00
for well in experiment.well_images(0, 0):
...
从文件名中提取属性
from leicaimage import attribute
# get all channels
channels = [attribute(image, 'C') for image in experiment.images]
min_ch, max_ch = min(channels), max(channels)
致谢
此软件包是由Copier和browniebroke/pypackage-template项目模板创建的。
项目详情
下载文件
下载适合您平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解更多关于安装包的信息。
源分发
leicaimage-0.4.0.tar.gz (6.3 kB 查看哈希值)
构建分发
leicaimage-0.4.0-py3-none-any.whl (6.2 kB 查看哈希值)
关闭
leicaimage-0.4.0.tar.gz的哈希值
算法 | 哈希摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | 6fcc083e4e6214203c8767eda4f68b297443d72ff1d939c442faece7c8b8eb73 |
|
MD5 | 33bd37848f3b0b588e6c16bec6d52295 |
|
BLAKE2b-256 | 2c6175db2964ad39696768c402974c3f1bae2fe6f0fb64b26bdf6f9828b773eb |
关闭
leicaimage-0.4.0-py3-none-any.whl的哈希值
算法 | 哈希摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | 99400f53e75db075ac77160104e090fdcdc2cf991fdabdd9e1cda7a3317cee1b |
|
MD5 | 5d7c547d491172cb2a0d537361046944 |
|
BLAKE2b-256 | e4c110ed6ba1d6ed22a7e7a07b80794d399928289fc917d6d63fd8fe12df3970 |