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使用外部光探头校准您的LED。

项目描述

Pioreactor LED校准插件

CI tests

在Pioreactor上可用的LED自动化有限:光强度百分比基于供应到LED线缆的功率。对于特定研究和比较Pioreactor之间的结果,此插件可以用来确定确切的LED强度值。

此插件提供使用 外部光探头 校准您的LED的能力。它分为两部分

  1. 命令行校准,创建最佳拟合线,
  2. 以及Pioreactor网页界面上可用的校准光/暗周期自动化。

安装说明

从命令行安装。

pio install-plugin led-calibration-plugin  ## to install on a single Pioreactor

## OR, on the command line of the leader Pioreactor

pios install-plugin led-calibration-plugin ## to install on all Pioreactors in a cluster

此插件还可在Pioreactor网页界面的 插件 标签中找到。通过网页界面下载将在集群中的所有Pioreactor上安装。

运行您的校准

在您的命令行中输入

pio run led_calibration

要执行此校准,将含有培养基的试管插入Pioreactor,并将光探头浸没其中。按照命令行的提示操作。插件将增加光强度,并提示您记录光探头读数。将根据您的光探头读数生成最佳拟合校准线。

在UI上使用校准

网页界面上将提供自动化。要使用此自动化,请在C和D通道中使用两条LED线缆,并将灯泡插入Pioreactor试管夹的X2和X3口袋中。C和D通道中的LED校准必须存在。

在《Pioreactors》标签页下,点击《管理》后,您可以启动LED自动化》。在下拉菜单中新增了一个名为“校准光/暗周期”的选项。输入您期望的光强度(例如:1000 AU)。自动化设置将光强度百分比,以便在两个LED上同时出现1000 AU的输出。

子命令

通过在命令行输入以下内容来运行子命令

pio run led_calibration <SUBCOMMAND>

以下子命令可用

list

打印存储在领导者上的所有现有校准的表格。标题包括唯一名称、时间戳和通道。

名称 时间戳 通道 当前是否在使用中?
Algae_C_2022 2022-08-29T20:12:00.400000Z C
Algae_B_2022 2022-08-29T20:13:00.400000Z B
Algae_B_2021 2021-08-29T20:15:00.400000Z B

display

显示当前通道A、B、C和D(如果存在)的当前校准的图表和数据。例如,对于上面的数据,将显示Algae_C_2022和Algae_B_2022的当前校准。

change_current

如果您想将当前校准更改为之前的校准,请使用change_current "<UNIQUE NAME>"。这些更改基于分配给校准的通道。

例如:pio run led_calibration change_current "Algae_B_2021"将替换Algae_B_2022,因为每个通道只有一个校准是活动的。

何时进行LED校准

校准应根据具体情况执行。每个通道必须进行新的校准,以及/或新的LED电缆,以及任何可能改变管内光强度的介质更改。

插件文档

有关插件的文档可以在Pioreactor维基上找到。

项目详情


下载文件

下载适用于您平台的文件。如果您不确定选择哪个,请了解更多关于安装包的信息。

源分发

led_calibration_plugin-1.3.0.tar.gz (10.7 kB 查看哈希值)

上传时间:

构建分发

led_calibration_plugin-1.3.0-py3-none-any.whl (10.9 kB 查看哈希值)

上传时间: Python 3

由以下提供支持