LAMMPS接口

作者

• Peter Boyd
• Mohamad Moosavi
• Matthew Witman

描述

该程序旨在轻松实现晶体学信息文件 (.cif) 与大型原子分子质量并行模拟器 (Lammps) 之间的接口。

安装

简单从PyPI安装

pip install lammps-interface

为了开发目的，克隆存储库并从源代码安装它

pip install -e .

注意：在这两种情况下，这会将 lammps-interface 添加到您的 PATH 中。

使用方法

命令行界面

要查看可选参数，请输入

lammps-interface --help

为给定的cif文件类型创建Lammps模拟文件

lammps-interface cif_file.cif

这将创建具有UFF参数的Lammps模拟文件。

Jupyter笔记本

为了将lammps-interface集成到您的项目中，请查看/notebooks目录中提供的Jupyter笔记本，以获取使用示例。

许可证

MIT许可证（见LICENSE）

引用

与此代码相关的出版物可在以下位置找到

Boyd, P. G., Moosavi, S. M., Witman, M. & Smit, B. 金属有机框架中材料性质的力场预测。J. Phys. Chem. Lett. 8, 357-363 (2017)。

https://dx.doi.org/10.1021/acs.jpclett.6b02532