keras-biological-gaps-sequence 1.0.3

我如何安装此包？

像往常一样，只需使用pip下载即可

pip install keras_biological_gaps_sequences

测试覆盖率

由于某些处理覆盖率的软件有时会得到略有不同的结果，这里列出了三个

可用数据集

目前，包内只包含一个间隔数据集：已知间隔从hg19到hg38的映射。未来我们将添加更多映射。

使用示例

要使用序列，您可以这样做

biological_gap_sequence = BiologicalGapsSequence(
    source="hg19",
    target="hg38",
    source_window_size=1000,
    target_window_size=1000,
    batch_size=32
)

model = build_my_denoiser()
model.fit_generator(
    biological_gap_sequence,
    steps_per_epoch=biological_gap_sequence.steps_per_epoch,
    epochs=2,
    shuffle=True
)