一个用于查看分子轨道的JupyterLab启动器扩展。
项目描述
jupyterlab-mol-visualizer
:一个用于可视化分子轨道的JupyterLab扩展
一个用于查看分子轨道(MO)的JupyterLab启动器扩展。使用了NGL JavaScript包来可视化MO。扩展的图标来自SVG Repo。
使用Binder尝试
需求
- JupyterLab >= 4.0.0
安装
要安装扩展,执行
pip install jupyterlab_mol_visualizer
卸载
要删除扩展,执行
pip uninstall jupyterlab_mol_visualizer
贡献
开发安装
注意:您将需要NodeJS来构建扩展包。
jlpm
命令是JupyterLab附带的yarn的固定版本。您可以使用下面的yarn
或npm
代替jlpm
。
# Clone the repo to your local environment
# Change directory to the jupyterlab_mol_visualizer directory
# Install package in development mode
pip install -e "."
# Link your development version of the extension with JupyterLab
jupyter labextension develop . --overwrite
# Rebuild extension Typescript source after making changes
jlpm build
您可以在不同的终端中同时监视源目录并运行JupyterLab,以监视扩展源的变化并自动重新构建扩展。
# Watch the source directory in one terminal, automatically rebuilding when needed
jlpm watch
# Run JupyterLab in another terminal
jupyter lab
当监视命令运行时,每次保存的更改都将立即在本地构建并可供您运行的JupyterLab使用。刷新JupyterLab以在浏览器中加载更改(您可能需要等待几秒钟以重新构建扩展)。
默认情况下,jlpm build
命令为该扩展生成源映射,以便使用浏览器开发者工具进行调试。要同时为JupyterLab核心扩展生成源映射,可以运行以下命令
jupyter lab build --minimize=False
开发模式卸载
pip uninstall jupyterlab_mol_visualizer
在开发模式下,您还需要删除jupyter labextension develop
命令创建的符号链接。要找到其位置,可以运行jupyter labextension list
以确定labextensions
文件夹的位置。然后,您可以删除该文件夹中名为jupyterlab_mol_visualizer
的符号链接。
测试扩展
前端测试
此扩展使用Jest进行JavaScript代码测试。
要执行它们,请执行
jlpm
jlpm test
集成测试
此扩展使用Playwright进行集成测试(即用户级测试)。更具体地说,JupyterLab助手Galata用于处理在JupyterLab中测试扩展。
更多信息请参阅ui-tests的README。
打包扩展
致谢
我们感谢EPFL开放科学基金通过OSSCAR项目提供的支持。
项目详情
关闭
jupyterlab_mol_visualizer-1.0.0.tar.gz的散列
算法 | 散列摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | ed70675c51f71c524bdd8341740f87e9a53d921396a966e9e119600bcb04f8ef |
|
MD5 | f88563dad5120cdad2710dde5fcaba4b |
|
BLAKE2b-256 | 2f0eaa5ec87a2fe7722a6b06b458b63a9d4d4f708b9ff97198568046f79dcdb0 |
关闭
jupyterlab_mol_visualizer-1.0.0-py3-none-any.whl的散列
算法 | 散列摘要 | |
---|---|---|
SHA256 | d3d7e9354ba3a5995a93de61bdd28a73272554cb5c1edb474345a4f2afad518b |
|
MD5 | 122c7598e9593c2864e17059331305c9 |
|
BLAKE2b-256 | 8ace75632ab9c092a9ee8ebc2c5bcb649430186e8af44e4ad2ff65a82df929b7 |