A JupyterLab extension to explore and visualize HDF5 file contents.
项目描述
jupyterlab-h5web
jupyterlab-h5web是一个用于探索和可视化HDF5文件内容的JupyterLab扩展，使用基于Web的查看器h5web。h5web支持NeXus格式。
有关详细信息，请参阅用法。
需求
- JupyterLab 4
下表显示了较早的JupyterLab版本
兼容性表
| JupyterLab 2 | JupyterLab 3 | JupyterLab 4 | |
|---|---|---|---|
| 扩展版本范围 | 0.0.1 - 0.3.0 |
1.0.0 - 8.0.0 |
10.0.0 - ... |
安装
使用pip
pip install jupyterlab_h5web
为了启用对额外过滤器（如blosc或bitshuffle）的支持
pip install jupyterlab_h5web[full]
这将安装hdf5plugin，除了扩展之外。
使用conda
conda install -c conda-forge jupyterlab-h5web
用法
此扩展允许在JupyterLab标签中打开HDF5文件，并在Jupyter笔记本中探索HDF5文件。
在JupyterLab中
您可以通过双击HDF5文件或右键单击打开方式 -> h5web来打开一个标签。
此标签由一个侧边栏和一个主区域组成，您可以在侧边栏中探索HDF5文件的结构，在主区域中进行所选实体的可视化。此可视化由右上角的按钮控制，可以在以下选项之间切换：
- 显示：使用
线、热图或矩阵可视化来可视化数据集。 - 检查：显示任何实体的元数据和属性
在Jupyter笔记本中
要使用H5Web打开HDF5文件，请在一个笔记本单元中使用H5Web小部件。
from jupyterlab_h5web import H5Web
H5Web('<path to the HDF5 file>')
可以通过右下角的把手调整单元的高度。
示例请参阅example.ipynb。
支持的文件格式
jupyter-h5web根据文件扩展名检测HDF5文件。查看器适用于以下扩展
对于其他类型的文件，您可以将其扩展名更改为支持的扩展名，或者如果您认为它很常见，可以打开一个问题来讨论其支持。
变更日志
请参阅https://github.com/silx-kit/jupyterlab-h5web/releases。
故障排除
如果以下说明不能解决您的问题，您可以在GitHub上打开问题。
检查服务器扩展
如果您看到前端扩展但无法使用，请检查jupyterlab_h5web是否已安装并启用。
运行时应该会列出
jupyter server extension list
如果jupyterlab_h5web未出现或已禁用，请尝试启用它
jupyter server extension enable jupyterlab_h5web
检查前端扩展
如果jupyterlab_h5web已安装并启用，但您看不到前端，请检查前端是否已安装
jupyter labextension list
卸载
pip uninstall jupyterlab_h5web
下载文件
下载您平台上的文件。如果您不确定选择哪一个，请了解更多关于安装包的信息。
源分发
构建版本
jupyterlab_h5web-12.3.0.tar.gz的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 117686d4a5185c03f86d6ba1e5da9c51be170d5bc22f5dc930cb5d48a1d46150 |
|
| MD5 | 2286c05bb806b8386689d3ca96248d27 |
|
| BLAKE2b-256 | a00644917ba842100a62794be927311048b77e8552f22e59191543d5c95a3924 |
jupyterlab_h5web-12.3.0-py3-none-any.whl的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 75aafa5c622cd5882161ea4865acdefdbfa59eecea57a1bf3fa6d600297554af |
|
| MD5 | 1d858f6049d75ea674bde67682809e2f |
|
| BLAKE2b-256 | cedb5b410f50ee00907e401a56ba2b3e8d7e1e7a01918b1b0578780e516a9ea4 |