jax-unirep

JAX中对UniRep蛋白质特征化模型的高性能重实现。

UniRep模型是在George Church的实验室开发的，请参阅原始出版物此处（bioRxiv）或此处（Nature Methods），以及包含原始模型的存储库。

此存储库是UniRep模型的独立和易于定制的版本，包括支持蛋白质工程工作流程的附加实用API。

安装

确保您的计算环境允许您运行JAX代码。（现代Linux或macOS与GLIBC>=2.23可能是必要的。）

然后，您可以从PyPI安装

pip install jax-unirep

如果您想要最新和最好的，您可以直接从源代码安装

pip install git+https://github.com/ElArkk/jax-unirep.git

更多详情

有关如何使用jax-unirep的文档可在此处找到。

我们强烈鼓励社区对该项目做出贡献！有关更多信息，请参阅文档中的贡献指南部分。

想了解更多关于我们如何在JAX中重新实现模型的信息，请查看我们在上的预印本：bioarxiv。

许可协议

所有模型权重均按照Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License的条款授权。要查看此许可证的副本，请访问此处或发送信件至Creative Commons，PO Box 1866，Mountain View，CA 94042，USA。

否则，本存储库中的代码按照GPL v3的条款授权。