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可解释自动编码器

项目描述

Intercode - 可解释自动编码器

Intercode 是一个用于学习单细胞数据的可解释潜在表示的软件包。Intercode 包含了一个自动编码器的实现,该编码器强制潜在维度与预定义的基因集相对应。

使用和安装

Intercode 需要 pytorch, numpy 和 anndata。

使用 pip 安装

::

pip install intercode

请参阅 笔记本 <https://github.com/theislab/intercode/tree/main/notebooks> 中的示例。

阅读 预印本 <https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.02.401182v1> 以获取描述。

项目详情


下载文件

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源代码分发

intercode-0.0.7.tar.gz (741.0 kB 查看哈希值)

上传时间 源代码

构建分发

intercode-0.0.7-py3-none-any.whl (9.1 kB 查看散列值)

上传时间: Python 3

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