imglyb-examples

这是一个imglyb示例的仓库。

依赖项

通过conda安装imglyb-examples时，所有依赖项都将自动安装。

• imglyb
• numpy
• scikit-image

imglyb在conda中可用，或者您可以按照构建说明手动安装。所有其他依赖项都可通过您的包管理器、pip或各种anaconda通道获取。

安装

手动

首先，确保已安装所有依赖项，然后运行

python setup.py install

Conda

conda install -c hanslovsky imglyb-examples

如果之前未安装imglyb，请在安装后重新源当前conda环境以正确设置环境。

运行

这些示例可用。

# bash
# Basic visualization and application of Python and ImgLib2 filters
python -m imglyb_examples.butterfly
# Python implemented overlays for BigDataViewer
python -m imglyb_examples.bdv_hello_world
# Python implementation of a painting tool for BigDataViewer
python -m imglyb_examples.bdv_painter
# Embed BigDataViewer in Qt application (only Linux, and Qt and python-xlib dependencies)
python -m imglyb_examples.qt_awt
# Basic visualization of series of 2D NumPy arrays
python -m imglyb_examples.views_stack

我建议从这些示例开始您的代码，并根据需要扩展。在Linux和Windows上，您也可以像这样运行这些命令

imglyb-examples.butterfly
imglyb-examples.bdv-hello-world
imglyb-examples.bdv-painter
mglyb-examples.qt-awt
imglyb-examples.views-stack