imglyb-bdv

imglyb-bdv通过添加来自imglyb和BigDataViewer的便捷方法和结构扩展了imglyb

如果您对使用imglyb-bdv感兴趣，请查看examples文件夹并按需扩展示例！

安装

先决条件

imglyb-bdv已在Linux、macOS和Windows上进行了测试。

以下工具是必需的

• Python 3
• Java 8或11 JDK（仅JRE不够）
• Apache Maven

如果您使用conda，这些将为您安装。

使用conda安装

conda install -c conda-forge imglyb-bdv

使用pip安装

首先，安装上述先决条件。然后运行

pip install imglyb-bdv

建议在虚拟环境或conda环境中执行此操作，而不是系统范围内。

从源安装

首先，安装上述先决条件。然后运行

git clone git://github.com/imglib/imglyb-bdv
cd imglyb-bdv
pip install -e .

建议在虚拟环境或conda环境中执行此操作，而不是系统范围内。

用法

建议根据您的需求遵循并扩展examples文件夹中的示例。请注意，示例具有额外的依赖项（hdf5和/或dask）。

或者，为了更高级地使用imglyb，请查看pyimagej。