iCount 2.0.0

iCount: 蛋白-RNA相互作用分析

iCount是一个Python模块和相关的命令行界面（CLI），它提供了处理iCLIP数据所需的全部命令，用于蛋白质-RNA相互作用，并生成

• 适配器修剪的FASTQ文件，

• 映射的iCLIP读取的BAM文件，

• 识别的蛋白质-RNA交联位点，保存到BED文件，

• 由统计上显著的交联位点组成的峰，保存到BED文件，

• 显著交联位点的簇，保存到BED文件，

• 单个重复实验的分组，

• 显示交联位点相对于基因组标志物位置分布的RNAmap生成，

• kmer富集分析，

• 以及其他。

您可以从教程开始，或者深入了解文档。