Python中处理人类表型本体学的工具包
项目描述
hpo-toolkit
一个用于在Python中处理人类表型本体学（HPO）和HPO疾病注释的工具包。
示例
加载HPO就像这样简单
import hpotk
store = hpotk.configure_ontology_store()
hpo = store.load_hpo()
现在您手头上有了最新HPO版本的概念和层次结构。
接下来，通过运行以下命令加载HPO疾病注释
from hpotk.annotations.load.hpoa import SimpleHpoaDiseaseLoader
hpoa_path = 'https://github.com/obophenotype/human-phenotype-ontology/releases/download/v2023-10-09/phenotype.hpoa'
loader = SimpleHpoaDiseaseLoader(hpo)
diseases = loader.load(hpoa_path)
assert len(diseases) == 12_468
您已经获得了12,468种罕见疾病的表型注释。
了解更多信息
在我们的详细文档中找到更多信息
下载文件
下载适用于您平台的文件。如果您不确定选择哪个，请了解有关安装包的更多信息。
源分布
hpo_toolkit-0.5.3.tar.gz (103.9 kB 查看散列值)
构建分布
hpo_toolkit-0.5.3-py3-none-any.whl (108.4 kB 查看散列值)
关闭
hpo_toolkit-0.5.3.tar.gz的散列值
| 算法 | 散列摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | ff69c33cfdcff2899b57765e7f871264e1b194870edd01f86ff9bd731d532bf9 |
|
| MD5 | eda6e5aba09dbc20e1d70b38fc1ae411 |
|
| BLAKE2b-256 | 898fe3a4e9a02efae0800c025494ec745388a2855516ab295b965bc57a83d344 |
关闭
hpo_toolkit-0.5.3-py3-none-any.whl的散列值
| 算法 | 散列摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 331a7479be71c74d3ab687a1822bde6168744681fc3bafe35824f1ed130d9eeb |
|
| MD5 | cd6d595e5e91ccab9c51fea9a9ed6764 |
|
| BLAKE2b-256 | 431815ebf37edc7bad06d6742730f191eccdea53bb662367c7f10ef53bab0719 |