辅助包，实现了HiCExplorer、pyGenomeTracks和scHiCExplorer的HiCMatrix类。
项目描述
此库实现了HiCExplorer的核心类来管理Hi-C交互矩阵。它从主项目中分离出来，以便在其他项目中使用Hi-C矩阵而不依赖于HiCExplorer。此外，它使我们能够在HiCExplorer中使用已经分离的pyGenomeTracks（前身为hicPlotTADs），因为相互依赖已得到解决。
从版本8开始，我们放弃了Python 2的支持。
版本14引入了对scHiCExplorer自版本5以来使用的scool文件格式的官方支持： https://github.com/joachimwolff/scHiCExplorer 和 https://schicexplorer.readthedocs.io/en/latest/。
读取支持
h5
cool / mcool / scool
hicpro
homer
写入支持
h5
cool / mcool
scool
homer
ginteractions
hicpro
引用
Joachim Wolff, Leily Rabbani, Ralf Gilsbach, Gautier Richard, Thomas Manke, Rolf Backofen, Björn A Grüning. Galaxy HiCExplorer 3：一个用于可重复性Hi-C、捕获Hi-C和单细胞Hi-C数据分析、质量控制和可视化的Web服务器，Nucleic Acids Research，第48卷，第W1期，2020年7月2日，第W177–W184页，https://doi.org/10.1093/nar/gkaa220
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源代码发行版
构建发行版
hicmatrix-17.2.tar.gz的散列
| 算法 | 散列摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | a333190a2b60d978e5fcb39efd874fca97630cd12c6e58e7e5ad8d7139e32078 |
|
| MD5 | 6521150d444ad6be9b97ae3667efe107 |
|
| BLAKE2b-256 | 59745163be902d0e4c985ed6367d4243f4c2930ef987faa9175d6c840dffa22b |
HiCMatrix-17.2-py3-none-any.whl的散列
| 算法 | 散列摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 6e926c3773fc0e6ac6ea0ffd9a800664c77849052de214fc2c387da07571d61a |
|
| MD5 | 69283091b372197a8a6e7d1e45fac465 |
|
| BLAKE2b-256 | 824d1fcf74ad06b114f3ae4a528f582bba38330cb71a5c4afe58e4752a8a7dd0 |