使用PyBEL在生物表达语言中关于血红素和溶血性疾病的机制知识
项目描述
在溶血性疾病背景下组装和建模关于血红素致病性和通路失调的知识。此存储库中的数据由Farah Humayun在她的硕士论文背景下整理。整理的文档位于hemekg目录中。
引用
如果您在您的工作中发现HemeKG很有用，请考虑引用
安装
要安装用于在此存储库中编程访问BEL文件的hemekg Python包，请在您的shell中使用以下代码
$ git clone https://github.com/hemekg/hemekg.git
$ cd hemekg
$ pip install -e .命令
要查看所有命令，只需运行
$ hemekg用法
要获取BEL图，请使用以下代码
>>> import hemekg
>>> graph = hemekg.get_graph()
>>> graph.summarize()注释
辅助注释位于hemekg/annotations目录中。这些包括
时间点。
物种。
浓度。
下载文件
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源码分发
hemekg-0.0.1.tar.gz (2.7 kB 查看哈希值)
构建分发
hemekg-0.0.1-py3-none-any.whl (6.0 kB 查看哈希值)
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hemekg-0.0.1.tar.gz 的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 2222838302a469ecc2bfd1232d008c5e3f11c954ca2ffb3bd1597c11a86d2080 |
|
| MD5 | d90e3cca199e3adf4c4ebdb240a2ea54 |
|
| BLAKE2b-256 | ac24c2adc7a5593cd83ccb3f47f1174595fd7e01bb4499d906005e7d1a4ce5ea |
关闭
hemekg-0.0.1-py3-none-any.whl 的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | c56fb7d7f6413236d29606d88887f5e07c5d3ab0c7ff0a41482fbf7d175ebd38 |
|
| MD5 | 593b80ec9cc1587cc9a6e798a138d6fc |
|
| BLAKE2b-256 | 228feff1d3976638d494727854861f03a1f3a1261c813595ab67a765b4a2a775 |