rpy2-complex-heatmap-grammar

使用直观的图形语法实现的Python热图接口，作为ComplexHeatmap包的rpy2包装器。

简介

本包是什么

• 对复杂热图创建梦想API的探索
• 尝试获取Python、ggplot2（/plotnine）和ComplexHeatmap的最佳之处
• 面向使用IPython（兼容）内核的Jupyter笔记本中的数据探索
• 通过rpy2推动Python-R互操作性

本包不是什么

• 可能不适合初学者（如果你在安装/使用rpy2之前不是初学者）
• 不是ComplexHeatmap的Python直接替代品
• 尚未准备好用于生产（API可能会更改）
• 与rpy2或ComplexHeatmap无关

感兴趣？查看示例。

安装

要求

• Python >=3.9
  • 软件包：rpy2、pandas、numpy、IPython
• R >=4.1
  • 软件包：ComplexHeatmap

从PyPI安装

pip install heatmap-grammar

最新版本

pip install git+https://github.com/krassowski/rpy2-complex-heatmap-grammar.git