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定义HDMF的Zarr I/O后端的软件包

项目描述

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hdmf-zarr

hdmf-zarr库实现了HDMF的Zarr后端以及方便的类,以支持将Zarr与PyNWB集成,以便将NWB文件写入Zarr。

状态: Zarr后端正在 开发中,可能还会发生变化。请参阅概述页面,以了解hdmf-zarr的功能概述和已知限制。

最新版本

Documentation Status

CI / 健康状态

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引用hdmf-zarr

如果您在研究中使用了HDMF或hdmf_zarr,请使用以下引用

  • A. J. Tritt, O. Ruebel, B. Dichter, R. Ly, D. Kang, E. F. Chang, L. M. Frank, K. Bouchard, “HDMF: 用于现代科学数据标准的分层数据建模框架,” 2019年IEEE国际大数据会议(大数据),洛杉矶,CA,美国,2019年,第165-179页,doi: 10.1109/BigData47090.2019.9005648。

  • HDMF-Zarr, RRID:SCR_022709

文档

有关详细信息,请参阅 hdmf-zarr 文档。https://hdmf-zarr.readthedocs.io/zh/latest/

使用方法

该库旨在与 HDMF 一起使用。hdmf-zarr 主要提供了 ZarrIO 类,作为 HDMF 随附的 HDF5IO I/O 后端的替代方案。为了支持 I/O 设置的自定义,hdmf-zarr 提供了 ZarrDataIO(类似于 HDMF 中的 H5DataIO)。使用 ZarrIOZarrDataIO 与使用 HDF5IO 方式大致相同。为了便于与 NWB 数据标准和 PyNWB 集成,hdmf-zarr 提供了 NWBZarrIO 类作为 pynwb.NWBHDF5IO 的替代方案。有关更多详细信息,请参阅文档中的教程。

项目详情


下载文件

下载适用于您的平台文件。如果您不确定选择哪个,请了解更多关于 安装包 的信息。

源分布

hdmf_zarr-0.9.0.tar.gz (3.1 MB 查看哈希值)

上传时间 源代码

构建分布

hdmf_zarr-0.9.0-py3-none-any.whl (32.6 kB 查看哈希值)

上传时间 Python 3

支持者