hca-bundle-jsonld 0.1.2

用法

“bundle_to_rdf”模块提供了一个将HCA打包文件转换为RDF ttl文件的方法。

import requests
import bundle_to_rdf

DSS_URL = "https://dss.dev.data.humancellatlas.org/v1"
bundle_uuid = "4be0071d-b36e-4414-a7ee-7b879f60be7c"

r = requests.get("{}/bundles/{}?replica=aws".format(DSS_URL, bundle_uuid))
bundle = r.json()

file_name = bundle_to_rdf.bundle_to_rdf(bundle)
print(file_name)

在当前工作目录中创建一个文件，文件名遵循以下模式：{bundle_uuid}.ttl。

然后可以将此文件加载到您选择的三角形存储中。有关与BlazeGraph一起使用的示例用法，请查看example-usage.ipynb。

开发

此模块应尽可能少地假设DSS数据模型。未来的开发将使用此模块作为服务的一部分，以创建可以直接查询或加载到图存储（如Blazegraph或Amazon Neptune）中的RDF。