HMMER服务器
项目描述
欢迎使用h3daemon 👋
用于在arm64和amd64机器上运行HMMER服务器的命令行。
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⚡️ 要求
MacOS
安装Python和Pipx
brew update && brew install python pipx
确保您的PATH环境变量已全部设置
pipx ensurepath
💡 您可能需要关闭终端并重新打开它以使更改生效。
Ubuntu (and Debian-based distros)
安装Python和Pipx
sudo apt update && \
sudo apt install python3 python3-pip python3-venv --yes && \
python3 -m pip install --user pipx
确保您的PATH环境变量已全部设置
python3 -m pipx ensurepath
💡 您可能需要关闭终端并重新打开它以使更改生效。
📦 安装
pipx install h3daemon
用法
Usage: h3daemon [OPTIONS] COMMAND [ARGS]...
╭─ Options ─────────────────────────────────────────────────────╮
│ --version │
│ --help Show this message and exit. │
╰───────────────────────────────────────────────────────────────╯
╭─ Commands ────────────────────────────────────────────────────╮
│ start Start daemon. │
│ stop Stop daemon. │
╰───────────────────────────────────────────────────────────────╯
示例
下载minifam.hmm数据库
pipx run blx get \
fe305d9c09e123f987f49b9056e34c374e085d8831f815cc73d8ea4cdec84960 \
minifam.hmm
点击它
pipx run --spec hmmer hmmpress minifam.hmm
启动守护程序以监听随机（可用）端口
h3daemon start minifam.hmm
并停止它
h3daemon stop minifam.hmm
👤 作者
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下载文件
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源代码分布
h3daemon-0.14.5.tar.gz (7.5 kB 查看哈希值)
构建分布
h3daemon-0.14.5-py3-none-any.whl (9.9 kB 查看哈希值)
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h3daemon-0.14.5.tar.gz的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 1d3c0e45d9dd73407a7c5a888458b63d4c0154b79702dfb677d00fdaa791b31a |
|
| MD5 | b93bda647a7986b6f5ef3315983fd908 |
|
| BLAKE2b-256 | 3e7d70a5669aa13cc80c61604d708600704b0ae1687bec2afc87502dd393c8b8 |
关闭
h3daemon-0.14.5-py3-none-any.whl的哈希值
| 算法 | 哈希摘要 | |
|---|---|---|
| SHA256 | 8510e4fa4f800ee20d7400f997b887eb0d86109b406effaab03c7233585fff1b |
|
| MD5 | 7f61b73bed4ad31f87a3ebf0491ff6db |
|
| BLAKE2b-256 | 5fc4d4238e12d58ca9524ba3c5aeec45f43f12d6877ccd4484665b7508c70226 |