groupfilter 0.2

groupfilter - Morpheus搜索引擎结果的高效过滤软件工具

groupfilter是一个基于pyteomics (http://pythonhosted.org/pyteomics/)软件包的模块，它增加了Morpheus搜索引擎结果中FDR阈值以上的鉴定数量。

依赖关系

• pyteomics (>= 3.0)

• numpy

如何安装

• 安装groupfilter的最佳方式是使用pip: pip install numpy pyteomics groupfilter。

• 或者，您可以下载每个库的源代码，并分别运行python setup.py install。

• 根据您的平台，可能还有其他安装numpy的方法。

如何使用

groupfilter.py file1.tsv [file2.tsv ...] db.fasta

位置参数

文件列表：Morpheus PSM文件

db.fasta：FASTA文件路径

链接

• PyPI: https://pypi.python.org/pypi/groupfilter

• BitBucket仓库 & 问题跟踪器: https://bitbucket.org/levitsky/groupfilter

• 邮件列表: pyteomics@googlegroups.com