monkeybrains

monkeybrains是Girder的一个第三方插件，即非核心插件。

它有以下目标

• 在Girder中演示数据集可视化能力
• 针对Girder中的特定集合
• 在公共Girder实例上运行，而不会干扰其他集合

用法

将monkeybrains作为Girder插件启用，然后在集合上使用monkeybrains API调用激活特定集合，您可以在Swagger中这样做。这是故意隐藏的，以免其他集合意外启用该功能。

PUT
http://localhost:8082/api/v1/collection/550701fd0640fd09bf7d6f51/monkeybrains?monkeybrains=true

一旦将monkeybrains属性添加到您的集合中，当您编辑集合时，将在描述下方出现一个新组件，允许您在集合上添加Markdown信息页面。此信息页面将在Girder中的集合页面顶部以Markdown格式渲染，尽管在标记中任何内联HTML都将被清理。

在您的收藏中还会显示一个图表，显示纵向数据集的可视化。这依赖于monkeybrains插件中的API调用getDatasetEvents，该调用在目标收藏中查找具有scan_date元数据键的文件夹，并返回以下这些文件夹的元数据集

• _id
• baseParentId
• parentId
• meta.folder_type
• meta.scan_age
• meta.sex
• meta.scan_date
• meta.subject_id
• meta.dob
• meta.scan_weight_kg

这些元数据用于创建纵向显示，并允许在显示的某些部分上鼠标点击事件以导航到相关的Girder文件夹。

发布

要发布此插件的新版本

• 在setup.py中增加版本号
• 运行tox -e release
• 提交更改