get-some-ncbi-genomes

安装

pip install get-some-ncbi-genomes

用法

给定访问号下载一个或多个NCBI基因组。

构建包含下载信息的CSV文件

get-some-ncbi-genomes GCA_002440745.1 --csv xyz.csv

直接下载基因组文件

get-some-ncbi-genomes --output-dir genomes/ --download-genomes GCA_002440745.1

使用sourmash插件下载基因组文件并创建info.csv

sourmash scripts get-genomes GCA_002440745.1

支持

我们建议在 sourmash的主要问题跟踪器 中提交问题，因为那里会得到更多的关注！

开发者文档

get-some-ncbi-genomes 由 https://github.com/ctb/get-some-ncbi-genomes/ 开发

测试

运行

pytest tests

生成发布

在 pyproject.toml 中提升版本号并推送。

在GitHub上创建新的发布。

然后拉取，并

python -m build

随后执行 twine upload dist/...。