Galaxy XML生成库
项目描述
这些库将支持构建Tool XML和Tool Dependencies XML。如果您有兴趣支持Galaxy支持的任何其他XML,请创建一个issue或PR。
已知错误
没有唯一名称的验证
重复项未正确命名
条件/whens未正确命名
在CLI中未处理条件
许可证
Apache许可证,第2版
变更日志
0.5.2
调试构建
0.5.1
调试构建
0.5.0
添加对toolprofile的支持 (@fubar2)
删除默认stdio添加 (@fubar2)
Github Actions (@bernt-matthias)
0.4.14
修复TestRepeats (@fubar2)
0.4.13
添加TestOutputCollection、TestRepeat和测试(感谢 @fubar2)
0.4.12
为planemo正确排序元素(感谢 @fubar2)
在加载工具时正确读取stdio(感谢 @fubar2)
0.4.11
更新到命令行覆盖(感谢 @fubar2)
0.4.10
允许覆盖命令行以支持位置参数(感谢 @fubar2)
0.4.9
修复文本参数的引号(感谢 @fubar2!)
0.4.8
修复travis部署过程
修复测试
仅py36
0.4.6
弃用py2
将版本命令包装在CDATA中
0.4.5
错误修复
将捕获的错误写入日志而不是STDOUT
修复Travis:安装 xmllint
修复Travis:处理新的 flake8 异常限制
0.4.3
错误修复
允许在 <outputs> 中的 <data> 内使用 <discover_dataset>
允许导入没有描述的现有XML
0.4.2
添加检查EDAM和引用存在的方法(感谢 @khillion)
0.4.0
添加导入现有Galaxy xml的功能
0.3.3
@khillion 实现了以下功能
<options> 与 <filter> 和 <column>
<container> 用于 <requirements>
开始添加 <tests> 部分
<inputs> 中的 <section>
<outputs> 中的 <collection> 有 <discover_datasets>
请注意,tool.parameters.OutputParam() 已更改为 tool.parameters.OutputData()
0.3.2
configfiles (#8)
0.3.0
Travis在新标签上自动部署
测试
p3k
0.2.3
第一个广泛使用/稳定版本
项目详情
下载文件
下载适用于您平台的自定义文件。如果您不确定选择哪个,请了解更多关于 安装包 的信息。