Galaxy的Argparse包装器
项目描述
您编写类似这样的内容，包含关于工具的所有必要信息；选项、测试用例、元数据
from galaxygetopt.ggo import GalaxyGetOpt as GGO
c = GGO(
options=[
['int', 'An integer parameter', {'required': True, 'validate':
'Int', 'default': 10}],
['float', 'A float', {'required': True, 'validate': 'Float',
'default': 1e-4}],
['string', 'A string value', {'required': True, 'multiple': True,
'default': ['Hello', 'World'],
'validate': 'String'}],然后以字典的形式返回数据
{'int': 40, 'float': '1e-4', 'string': ['Hello', 'World'] }已知错误
目前，在Galaxy XML中存在一个已知错误，在非常特定的情况下。如果您定义了一个必需的、隐藏的、验证字符串的参数（可能不是硬性要求）和_galaxy_specific，并期望它正确生成值，则它不会。请参阅galaxygetopt/ggo.py的第206/207行，了解我用来绕过这个问题的当前修补程序。
必需的
隐藏的
validate String（可能不是硬性要求）
_galaxy_specific
并期望它正确生成值，则它不会。请参阅galaxygetopt/ggo.py的第206/207行，了解我用来绕过这个问题的当前修补程序。
其他
此库具有多个galaxygetopt.parameter.parameter子类的实例，每个实例都有许多选项。为了对这些选项进行彻底测试，我添加了一个名为galaxygetopt/tests/parameter_generator.py的类，该类可以生成您指定的规则下所有可能的函数调用组合。然后，您可以生成具有不同选项集的数百个对象，然后您可以筛选出子集并随意测试。有关更多信息，请参阅该类的文档。
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源代码分发
galaxygetopt-0.9.8.tar.gz (16.2 kB 查看散列值)
构建分发
galaxygetopt-0.9.8.linux-x86_64.tar.gz (38.0 kB 查看散列值)
galaxygetopt-0.9.8-py2.7.egg (61.2 kB 查看散列值)